São Rufino Sé foi iniciado pelo Bispo Clarissimus em 1134 a partir de desenhos de Giovanni da Gubbio. A fachada é um clássico Umbrian-Spoletian estilo com muita decoração, incluindo esculturas e baixos-relevos. No interior, tem 3 naves de 1571 que foram modificados para Galeazzo Alessi em estilo renascentista. A letra é uma das peças originais da Igreja e localizado no lado direito da gôndola. Esta letra tem visto alguns famosos, incluindo os dos christenings, São Francisco, Santa Clara, e Frederick II da Swabia, que cresceu em imperial a fortaleza de Assis.