Wanneer Luca Ghini, die de Botanische Tuin van de Universiteit van Pisa in 1544 werd hij benoemd tot professor in de geneeskunde en plantkunde door Cosimo I de 'Medici. De originele stoel was in de Medici-arsenaal maar het was verplaatst naar de San Francesco district van Pisa en later, in 1591, naar de plaats waar het vandaag is. Het doel van de botanische tuin werd voor het bestuderen van planten voor geneeskundig gebruik. Er zijn enkele zeldzame rassen hier en de tuinen kunnen worden bezocht met een gids. Een deel van de 16de eeuw gebouw behoudt de oorspronkelijke gevel, die is versierd met een mozaïek van schelpen en stenen.