Dit museum herbergt een groot aantal prachtige kunstwerken, waaronder een 13e eeuws tweeluik in een Byzantijnse draagbare altaar en enkele mooie geschilderde kruisbeelden. De fresco's bevatten een vrijstaande 17de eeuw een op de legende van de heilige Franciscus en de Wolf, een boom van Jesse door een Cinquecento Gubbio kunstenaar, de Quattrocento Madonna del Melograno door Pier Francesco Florentini, een vlucht die in Egypte door Rutilio Manetti, en een anoniem werk van de 1600s zogenaamde Last Night van Babylon. De kamers van de Pinacoteca zijn een attractie op zichzelf - sommige niet zijn gerenoveerd sinds de 16de eeuw.