Sainte Claire, ainsi que ses compagnons, se sont installés ici en 1212. Il était également là que saint François a écrit son Cantique des Créatures (Cantico delle Creature) en 1224. Il existe de belles fresques du 16ème siècle par Tiberio d'Assisi, dans la chapelle du 14ème siècle et des fresques dans l'abside. Un couloir mène au jardin de St Clare passant du 15ème siècle 'Crucifixion' par Pier Antonio Mezzastris. Plus fresques décorent le cloître et le réfectoire, y compris une description du crucifix qui aurait parlé à saint François.